３回戦の結果（９月２２日開催）
| 大宮アルディージャ | ５－０ | ジュビロ磐田 | |
| 湘南ベルマーレ | ４－０ | 徳島ヴォルティス | |
| ＡＣ長野パルセイロ | ２－３ | 横浜ＦＣ | |
| 大分トリニータ | ０－１ | 清水エスパルス | |
| 鹿島アントラーズ | ２－１ | ファジアーノ岡山 | |
| ヴィッセル神戸 | ３－３ | モンテディオ山形 | （ＰＫ：５－３） |
| アルビレックス新潟 | １－０ | レノファ山口ＦＣ | |
| 横浜Ｆ・マリノス | ４－０ | 東京ヴェルディ | |
| 柏レイソル | １－０ | 愛媛ＦＣ | |
| グルージャ盛岡 | １－２ | Ｈｏｎｄａ ＦＣ | |
| 川崎フロンターレ | ４－１ | ジェフユナイテッド千葉 | |
| サガン鳥栖 | ２－０ | セレッソ大阪 |
