３回戦の結果（８月１４日開催）
| 川崎フロンターレ | ２－１ | ファジアーノ岡山 |
| ジュビロ磐田 | ６－０ | ヴァンラーレ八戸 |
| 清水エスパルス | １－０ | アビスパ福岡 |
| ガンバ大阪 | ０－２ | 法政大学 |
| ＨｏｎｄａＦＣ | ２－０ | 徳島ヴォルティス |
| ヴィアティン三重 | ２－２（ＰＫ：４－５） | Ｖ・ファーレン長崎 |
| 浦和レッズ | ２－１ | 水戸ホーリーホック |
| 横浜Ｆ・マリノス | ２－１ | 横浜ＦＣ |
| サンフレッチェ広島 | ２－１ | ツエーゲン金沢 |
| 鹿屋体育大学 | １－２ | 大分トリニータ |
| セレッソ大阪 | ３－０ | レノファ山口ＦＣ |
| ヴィッセル神戸 | ４－０ | 大宮アルディージャ |
| 鹿島アントラーズ | ４－０ | 栃木ＳＣ |
| サガン鳥栖 | １－０ | 柏レイソル |
| ＦＣ東京 | ０－１ | ヴァンフォーレ甲府 |
| ベガルタ仙台 | １－０ | カターレ富山 |
